وفيما يلي أبرز قيادات عملية الكرامة المتهمين بارتكاب جرائم حرب: خليفة حفتر: من رفاق معمر القذافي في انقلاب 1969 على النظام الملكي بليبيا، تولى مهام عسكرية عدة كلفه بها القذافي، وعلى رأسها قيادة القوات الليبية بتشاد في ثمانينيات القرن الماضي. شارك في معارك الثوار ضد كتائب القذافي، ثم عينه المجلس الوطني الانتقالي قائدا للقوات البرية، وفي فبراير/شباط 2014 ألقى حفتر بيانا تلفزيونيا أعلن فيه تجميد الإعلان الدستوري، وحل المؤتمر الوطني العام، وفي 16 مايو/أيار 2014، أعلن انطلاق ما يعرف بعملية الكرامة لمكافحة الإرهاب. في اجتماع مع قواته في العام 2016، أعطى حفتر أوامره بتصفية خصومه من مقاتلي مجلس شورى ثوار بنغازي ومناوئيه في الميدان العسكري دون الحاجة إلى تقديمهم للمحاكمات، قائلا "يجب ألا تأخذكم شفقة ولا رحمة بخصومكم"، وهو يقصد مقاتلي مجلس شورى ثوار بنغازي.

وعقب الكشف عن الانتهاكات التي ارتكبها قياديون ومقاتلون في عملية الكرامة بمنطقة قنفودة غربي بنغازي في مارس/آذار 2017، تعهد حفتر بتقديم المقاتلين الذين نبشوا القبور ومثلوا بجثامين قيادات عسكرية تابعة لمجلس شورى ثوار بنغازي للمحاكمة وإحالة الفاعلين إلى إدارة الشرطة والسجون العسكرية التابعة لها. ونيس بوخمادة: قائد كتيبة القوات الخاصة المعروفة باسم "القوات الصاعقة" وهو من أبرز القادة العسكريين لما يعرف بعملية الكرامة، شارك في الحرب الليبية التشادية في ثمانينيات القرن الماضي، وكان بوخمادة قائدا عسكريا في جيش نظام القذافي. قاد منذ العام 2014 عملية الكرامة في منطقة قنفودة وأشرف على القصف الجوي والمدفعي الذي استهدف المدنيين المحاصرين داخل بؤر الاشتباكات.

وفي حديث له مع تجمع مع أبناء قبيلته (قبيلة المغاربة)، برر بوخمادة نبش القبور والتمثيل بالجثث والتنكيل بها في بنغازي بأنه أمر عادي على اعتبار أن من قام بها "هم جنود يعانون أمراضا نفسية جراء استمرارهم في المعارك وعدم خروجهم من محاور القتال لأكثر من عامين". فرج البرعصي: قبل العام 2011 كان ض